Con 80 años de historia, el Club Puebla ha experimentado sin duda etapas tanto buenas como malas, al igual que todos los equipos del país, pero indudablemente un capítulo especial tuvo lugar en 1999, cuando estuvo al borde del descenso, pero logró permanecer en la entonces primera división adquiriendo una franquicia.
En 1999, el equipo Unión de Curtidores consiguió su ascenso a la primera división, sin embargo, empresarios de la ciudad de Puebla se encargaron de comprar la franquicia para que su equipo recién descendido permaneciera en el máximo circuito.
Sin embargo, en el año 2005, durante el torneo Clausura, el equipo volvió a descender, pero esta vez no pudo evitarlo y permaneció en la segunda división hasta 2007, cuando logró regresar al máximo circuito.
Cabe mencionar que el Club Puebla ostenta el récord de la etapa más larga sin títulos de liga en el futbol mexicano.
El Club fue fundado el 7 de mayo de 1944 como Millonarios de Puebla, por empresarios españoles de la ciudad.
Inició en el Campo Mirador, inaugurado el 21 de mayo de 1944, y destacó con actuaciones sobresalientes hasta la mitad de la década de los 50, ganando dos títulos de Copa México.
En la temporada de 1955 a 1956 enfrentó su primera etapa complicada. En 1957 se retiró de la liga, en un receso que duró 7 años.
Ya como Club Puebla F.C., regresó al fútbol profesional en la Segunda División y jugó en el Estadio Olímpico General Ignacio Zaragoza. El 12 de noviembre de 1970 ganó la liguilla de promoción para ascender al máximo circuito profesional.
Fue entonces cuando comenzó su historia en el Estadio Cuauhtémoc, la cual ha perdurado por más de medio siglo.
Obtuvo su primer campeonato en el torneo 1982-1983 con Manuel Lapuente como director técnico, al vencer al Guadalajara. Seis años después, en el torneo 1988-1989, se coronó nuevamente bajo la dirección de Lapuente al derrotar a los Leones Negros.
Los datos en torno al Club de Fútbol Puebla ponen de manifiesto la importancia y fidelidad de su afición, que los ha respaldado a pesar de la escasez de campeonatos y las etapas críticas.
A lo largo de su historia, el Club ha sido campeón de la Copa Concacaf en la temporada 1990-1991; campeón de Campeones de México 1989/1990; dos veces campeón de México en las temporadas 1989/1990 y 1982/1983; cuatro veces campeón de la Copa México en las temporadas 1989/1990, 1987/1988, 1952/1953 y 1944/1945; campeón de la Supercopa de México en 2015 y campeón de la Copa México en la Clausura 2014/2015.
Ahora, con la llegada del Chepo de la Torre, Los Enfranjados vuelven a soñar.